Naslov | Fenotipska prezentacija konstitucijskih aberacija gena kromosoma 17 |
Naslov (engleski) | Phenotypic presentation of constitutional aberrations in chromosome 17 genes |
Autor | Marin Tomasović |
Mentor | Bernarda Lozić (mentor) |
Član povjerenstva | Joško Markić (predsjednik povjerenstva) |
Član povjerenstva | Ivana Unić (član povjerenstva) |
Član povjerenstva | Zenon Pogorelić (član povjerenstva) |
Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj | Sveučilište u Splitu Medicinski fakultet Split |
Datum i država obrane | 2023-07-14, Hrvatska |
Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana | BIOMEDICINA I ZDRAVSTVO Temeljne medicinske znanosti Genetika, genomika i proteomika čovjeka |
Sažetak | Ciljevi: Cilj istraživanja bio je usporediti genotipsko-fenotipsku korelaciju genetičkih bolesti
kromosoma 17 ispitanika s podacima iz znanstvene literature.
Materijali i metode: Retrospektivnim presječnim istraživanjem, provedenim u KBC-u Split
pri Klinici za dječje bolesti u razdoblju od 1. siječnja 2018. do 31. prosinca 2022., analizirani
su bolesnici s pozitivnim genetičkim nalazom aCGH i izdvojeni oni s konstitucijskom
aberacijom gena kromosoma 17. Iz druge skupine ispitanika testiranih MLPA i NGS metodama
izdvojeni su ispitanici s genetičkim nalazom patogenih i vjerojatno patogenih varijanti gena na
kromosomu 17. Istaknuti su podatci o lokusu, vrsti i veličini CNV-ova, morbidnim genima,
klasifikaciji varijante, dobi, spolu i fenotipu.
Rezultati: Pozitivan nalaz aCGH pretrage imao je 141 (16,5%) ispitanik od 852 ispitanika
uključenih u istraživanje. Od 141 ispitanika s CNV-ovima u 80 ispitanika (57%) je
dijagnosticirana delecija, u 40 (28%) duplikacija, a 21 (15%) ispitanik imao je složenu CNV.
Muški spol bio je učestaliji u sve tri skupine. Najzastupljeniji delecijski sindrom bio je na
kromosomu 22 (17%), a najzastupljeniji duplikacijski sindrom na kromosomu 15 (17,5%). Na
kromosomu 17 mikrodelecijski su sindromi (7/12) bili učestaliji od mikroduplikacijskih
sindroma (5/12). Najveći broj ispitanika (6/12) imao je ponavljajuću CNV regije 17q12 veličine
oko 1,4 Mb i fenotip sukladan opisanom u znanstvenoj literaturi. Od ukupno 602 ispitanika
testiranih MLPA i NGS metodom u istraživanje je uključeno jedanaest ispitanika s
dijagnosticiranom patogenom ili vjerojatnom patogenom varijantom gena kromosoma 17.
Dijagnosticirano je pet ispitanika s patogenom varijantom gena NF1 čija aberacija dovodi do
kliničke slike neurofibromatoze tip 1 i četiri ispitanika s patogenom varijantom gena PMP22
čija aberacija dovodi do kliničke slike CMT1A. Metodom aCGH dijagnosticirana su dva
ispitanika s neurofibromatozom tip 1 i jedan ispitanik s CMT1A bolešću.
Zaključci: Dijagnoza genetičke aberacije na kromosomu 17 postavljena je u većine ispitanika
u dobi do pet godina. Genetička potvrda kliničke dijagnoze koja je dobivena molekularno
citogenetičkim testiranjem je važna jer nam daje uvid u precizniju fenotipsku mapu gena
kromosoma 17. Fenotipska prezentacija genetičkih aberacija proučavanih ispitanika odgovara
podacima iz znanstvene literature. |
Sažetak (engleski) | Objectives: The objective of this research was to compare the genotype-phenotype correlation
of genetic diseases located on chromosome 17 in our subjects with results from scientific data.
Materials and methods: Through a retrospective cross-sectional study, conducted at the
University Hospital of Split at the Department of Pediatrics in the period from January 1st 2018
until December 31st 2022., we analyzed patients with a positive aCGH genetic finding and
selected subjects with a constitutional gene aberration of chromosome 17. From the second
group of subjects diagnosed by MLPA and NGS methods, we selected subjects with genetic
findings of pathogenic and likely pathogenic gene variants on chromosome 17. We presented
data on the gene locus, type and size of CNVs, morbid genes, variant classification, age, sex
and phenotype.
Results: We included in the research 141 (16.5%) subjects with positive aCGH test results out
of the total number of 852 subjects. Out of 141 subjects with CNVs 80 subjects (57%) were
diagnosed with deletions, 40 (28%) with duplications, and 21 (15%) subjects had complex
CNVs. The male gender was more frequent in all three groups. The most common deletion
syndrome was on chromosome 22 (17.5%), and the most common duplication syndrome was
on chromosome 15 (17.5%). On chromosome 17 microdeletion syndromes (7/12) were more
frequent than microduplication syndromes (5/12). The majority of subjects (6/12) had a
recurrent CNV of the 17q12 region with a size of around 1.4 Mb and with a phenotype
consistent with data described in the scientific literature. Out of a total of 602 subjects tested
by MLPA and NGS methods, 11 subjects with diagnosed pathogenic or likely pathogenic
variants of the chromosome 17 gene were included in the study. There were 5 subjects
diagnosed with a pathogenic variant of the NF1 gene whose aberration leads to the clinical
phenotype of neurofibromatosis type 1 and 4 subjects with a pathogenic variant of the PMP22
gene whose aberration leads to the clinical picture of CMT1A. Also, 2 subjects with
neurofibromatosis type 1 and 1 subject with CMT1A were diagnosed by aCGH method.
Conclusions: The diagnosis of genetic aberration on chromosome 17 was established in the
majority of subjects under the age of 5 years. Genetic confirmation of the clinical diagnosis
obtained by molecular cytogenetic testing is important because it gives us insight into a more
precise phenotypic map of chromosome 17 genes. The phenotypic presentation of the genetic
aberrations of the studied subjects corresponds with data from the scientific literature |
Ključne riječi |
|
Ključne riječi (engleski) |
|
Jezik | hrvatski |
URN:NBN | urn:nbn:hr:171:216673 |
Studijski program | Naziv: Medicina Vrsta studija: sveučilišni Stupanj studija: integrirani preddiplomski i diplomski Akademski / stručni naziv: doktor/doktorica medicine (dr. med.) |
Vrsta resursa | Tekst |
Način izrade datoteke | Izvorno digitalna |
Prava pristupa | Otvoreni pristup |
Uvjeti korištenja | |
Datum i vrijeme pohrane | 2023-07-13 08:50:14 |